Филип Михайлов започва кариерата си в УНИКА България през 2008 г. като младши финансов анализатор, по това време все още студент специалност Финанси в УНСС, където две години по-късно се дипломира. През следващите 13 години преминава през всички стъпала в йерархията на компанията, като от началото на 2022 г. се присъединява към Управителния съвет на УНИКА България.
През 2022 г. Филип Михайлов поема нова роля като Изпълнителен директор Финанси и Риск в регионалната структура на ЗК УНИКА за Югоизточна Европа.